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Text File  |  1995-03-04  |  3.2 KB  |  64 lines
  1. *************************
  2. * Sulfatases signatures *
  3. *************************
  4.  
  5. Sulfatases (EC 3.1.6.-) are enzymes that hydrolyze various sulfate esters. The
  6. sequence of different types of sulfatases are available. These enzymes are:
  7.  
  8.  - Arylsulfatase A (EC 3.1.6.8)  (ASA), a lysosomal  enzyme  which  hydrolyzes
  9.    cerebroside sulfate.
  10.  - Arylsulfatase B (EC 3.1.6.12) (ASB),  a  lysosomal enzyme  which hydrolyzes
  11.    the sulfate esters group from  N-acetylgalactosamine 4-sulfate  residues of
  12.    dermatan sulfate.
  13.  - Steryl-sulfatase  (EC 3.1.6.2) (STS)  (arylsulfatase C),  a  membrane bound
  14.    microsomal enzyme which hydrolyzes 3-beta-hydroxy steroid sulfates.
  15.  - Iduronate 2-sulfatase precursor (EC 3.1.6.13)  (IDS),  a  lysosomal  enzyme
  16.    that hydrolyzes the 2-sulfate  groups  from  non-reducing-terminal iduronic
  17.    acid residues in dermatan sulfate and heparan sulfate.
  18.  - N-acetylgalactosamine-6-sulfatase  (EC 3.1.6.4),  an enzyme that hydrolyzes
  19.    the 6-sulfate  groups  of  the  N-acetyl-d-galactosamine 6-sulfate units of
  20.    chondroitin sulfate and the D-galactose 6-sulfate units of keratan sulfate.
  21.  - Glucosamine-6-sulfatase   (EC 3.1.6.14)  (G6S),  a  lysosomal  enzyme  that
  22.    hydrolyzes the N-acetyl-D-glucosamine  6-sulfate  units  of heparan sulfate
  23.    and keratan sulfate.
  24.  
  25.  - Sea urchin embryo arylsulfatase (EC 3.1.6.1).
  26.  - Chlamydomonas reinhardtii arylsulfatase (EC 3.1.6.1), an enzyme which plays
  27.    an important role in the mineralization of sulfates.
  28.  - Escherichia coli arylsulfatase (EC 3.6.1.1) (gene aslA).
  29.  - Klebsiella aerogenes arylsulfatase (EC 3.6.1.1) (gene atsA).
  30.  - Escherichia coli hypothetical protein yidJ.
  31.  
  32. It has been shown that the mammalian  enzymes and the sea urchin sulfatase are
  33. structurally related  [1,2];    this   similarity can be extended to bacterial
  34. enzymes [3],  but  the  algal  [4]  enzyme does not show any similarity to the
  35. other sulfatases.
  36.  
  37. As signature patterns for that family of enzymes we have selected the two best
  38. conserved regions. Both regions are located in the N-terminal section of these
  39. enzymes.   The  first  region  contains  a conserved arginine which  could  be
  40. implicated in the catalytic mechanism.
  41.  
  42. -Consensus pattern: [SAP]-[LIVMS]-[SC]-x-P-[STA]-R-x(2)-[LIVMF](2)-T-G
  43.                     [R is a putative active site residue]
  44. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  45. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  46.  
  47. -Consensus pattern: G-Y-x-[ST]-x(2)-[LIVMA]-G-K-x(0,1)-[FYW]
  48. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  49. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  50.  
  51. -Last update: June 1994 / Patterns and text revised.
  52.  
  53. [ 1] Peters C., Schmidt B., Rommerskirch W., Rupp K., Zuehlsdorf M.,
  54.      Vingron M., Meyer H.E., Pohlmann R., von Figura K.
  55.      J. Biol. Chem. 265:3374-3381(1990).
  56. [ 2] Wilson P.J., Morris C.P., Anson D.S., Occhiodoro T., Bielicki J.,
  57.      Clements P.R., Hopwood J.J.
  58.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87:8531-8535(1990).
  59. [ 3] de Hostos E.L., Schilling J., Grossman A.R.
  60.      Mol. Gen. Genet. 218:229-239(1989).
  61. [ 4] Murooka Y., Ishibashi K., Yasumoto M., Sasaki M., Sugino H., Azakami H.,
  62.      Yamashita M.
  63.      J. Bacteriol. 172:2131-2140(1990).
  64.